- Altengottern (St. Trinitatis)
- Altengottern (St. Wigberti)
- Bad Langensalza (Bergkirche St. Stephani)
- Bad Langensalza (St. Bonifacii)
- Bad Tennstedt (Trinitatis und Nikolaikirche)
- Blankenburg (St. Bonifacius)
- Bollstedt (St. Bonifatius)
- Bothenheiligen (St. Christinae)
- Dörna
- Falken
- Flarchheim (St. Andreas)
- Görmar (St. Martini)
- Großballhausen (St. Viti)
- Großburschla (St. Bonifacii, St. Nicolai)
- Großengottern (St. Martini)
- Großengottern (St. Walpurgis)
- Großvargula (St. Jakobi)
- Großwelsbach (St. Blasii)
- Grumbach (St. Vincentius)
- Heiligenstadt (St. Martini)
- Henningsleben (Beatae Mariae Virginis)
- Hollenbach (St. Maria Magdalena)
- Horsmar (St. Pankratius)
- Isserheiligen (St. Johannes)
- Kleinballhausen
- Kleinvargula (St. Julianae)
- Kleinwelsbach (St. Mauritii)
- Kutzleben (St. Petri)
- Lengefeld (St. Johannes)
- Merxleben
- Mühlhausen (Allerheiligen)
- Mühlhausen (Militär)
- Mühlhausen (St. Blasii)
- Mühlhausen (St. Georgii)
- Mühlhausen (St. Jacobi)
- Mühlhausen (St. Kilian)
- Mühlhausen (St. Marien)
- Mühlhausen (St. Martini)
- Mühlhausen (St. Nicolai)
- Mühlhausen (St. Petri)
- Nägelstedt (St. Georg und St. Michael)
- Neunheiligen (St. Peter und Paul)
- Oppershausen (St. Marien)
- Pfafferode (Landesheilanstalt)
- Schnellmannshausen
- Seebach (St. Johannis)
- Sollstedt (St. Marien)
- Thamsbrück (St. Georg)
- Ufhoven
Kirchenkreis Mühlhausen
